Il faut demander une annotation à côté des questions, et non dans les marges (Édition/Préférences/Projet/Annotation des copies/Position de la note des questions).

sa me refais toujours le même soucis , les notes se superposent.

J'ai oublier le PDF

L'option de configuration a trois valeurs possibles : Dans la marge, Dans les deux marges, et À côté des cases. Votre deuxième PDF ressemble à ce qu'on obtiendrait avec Dans la marge. Êtes vous sûr d'avoir utilisé À côté des cases ?

Autant pour moi , je n'avais pas vu cet option . Le problème est que pour les 2 dernieres colonnes les notes sont mal placées .

J'ai toujours le même soucis avec les indicateurs de notes.