Pouvez-vous poster le code de votre question ?
Souahitez-vous mélanger les différentes propositions, qui sont, j'imagine, énoncées dans le corps de la question ?

Voici la question avec le groupe nominal.

\begin{question}{2}
\textbf{(3 points):} Indiquer parmi les propositions suivantes l'équation de réaction qui
modélise la méthanogénèse. 

\begin{reponses}
\bonne{\textbf{Proposition a : }\ch{CO2  + 4 H2  -> CH4  + 2 H2O}}
\mauvaise{ \textbf{Proposition b : } \ch{CO2  + 5 H2 -> CH4 + 3 H2O}}
\mauvaise{\textbf{Proposition c : }\ch{CH4 + 2 H2O  -> CO2 + 4 H2}}
\end{reponses}
\end{question}

Je voudrais que a, b et c puissent rester a,b et c quelque soit le mélange.

\bonne{\textbf{Proposition \aplh{counter{reponses} : }\ch{CO2  + 4 H2  -> CH4  + 2 H2O}}

On peut utiliser le compteur AMC@ncase :

% après le \begin{document}
\makeatletter
\def\proposition{\textbf{Proposition \alph{AMC@ncase} :}}
\makeatother

% ...
% et pour une question
\begin{question}{methanogenese}
\textbf{(3 points):} Indiquer parmi les propositions suivantes l'équation de réaction qui
modélise la méthanogénèse. 

\begin{reponses}
\bonne{\proposition{} \ch{CO2  + 4 H2  -> CH4  + 2 H2O}}
\mauvaise{\proposition{} \ch{CO2  + 5 H2 -> CH4 + 3 H2O}}
\mauvaise{\proposition{} \ch{CH4 + 2 H2O  -> CO2 + 4 H2}}
\end{reponses}
\end{question}

Merci, c'est exactement ce que je cherchais.

Si je trouve du temps, je pense mettre cette astuce dans la documentation et regarder dans le sty tous les compteurs existants pour voir si je ne peux pas en faire un paragraphe.